테넨바움 - 독일군 포로수용소에서 유전자 실험에 참여. 리틀 시스터를 만들었지만 현재는 리틀 시스터를 보호. 바다 민달팽이를 발견.
다이안 맥클린톡 - 앤드류 라이언의 연인. 극장에서 총격으로 부상. 스타인먼 박사에 의해 치료.
피치 윌킨스 - 폰테인 수산의 관리자(?), 아틀라스의 부탁을 받았지만 플레이어를 들여보내주지 않고 퀘스트(?)를 내어준다.
설리반 - 앤드류 라이언의 수하. 패트릭과 함께 티미를 고문. 사형까지 집행하려 하는 라이언에 점차 반감을 가짐.
패트릭 - 앤드류 라이언의 수하. 설리반과 함께 티미를 고문.
스티브 바커 - 극장 관리인.
브렌다 - 수리공(?) 배관공(?)
스타인먼 - 외과의사. 아담에 중독. 플레이어에게 렌치로 맞아 사망.
쟈니 - 아틀라스와 함께 플레이어를 도우려다 스플라이서에게 사망.
티미 - 프랑크 폰테인의 수하. 설리반과 패트릭에 의해 고문을 받다 사망.
스플라이서 - 플레이어를 공격하는 생명체들. 원래는 랩쳐의 시민들이었으나 플라스미드 중독으로 변화. 아담을 찾아 돌아다님.
빅 대디 - 크고 아름다운(?) 드릴 보유자. 리틀 시스터를 따라다니며 보호
리틀 시스터 - 주사기를 들고 다니는 여자 아이. 아담을 생산하고 보유. 빅 대디의 보호를 받음. 평범한 아이였으나 테넨바움에 의해 만들어짐. 몸 안에 민달팽이가 있어 플레이어가 민달팽이를 채취하면 죽게 되지만 구원하면 정상적인 아이로 돌아오게 된다. 상처를 입으면 줄기세포를 이용하여 재생한다.
바다 민달팽이 - 테넨바움이 밀수꾼에게서 발견한 치유 능력을 가진 달팽이.
[기타]
랩쳐 - 앤드류 라이언이 건설한 수중도시. 윤리적 제약이 없는 도시로 정신나간 과학자 및 개인주의자들의 파라다이스.
플라스미드 - 유전자 변형 약물로 여러 가지 능력을 부여.
아담 - 스플라이서들이 찾는 물질. 랩처를 움직이는 유전자 물질. 유전자 자판기에서 아담으로 플라스미드 구입 가능.
이브 - 플라스미드 사용시 소모되는 물질. 일종의 마나. 이브 주사로 충전 가능.
[스토리]
#1
플레이어가 타고 있던 비행기가 사고로 인해 대서양 한 가운데 추락.
겨우 목숨을 건진 플레이어 옆에는 등대가 있었고 등대 안에는 랩처로 가는 잠수정이 있었다.
스플라이서의 공격을 받는 도중에 플레이어는 플라스미드를 주사하여 전기를 내뿜는 능력을 배운다.
랩처에 도착한 플레이어는 가족과 함께 랩처를 탈출하고자 하는 아틀라스와 통신하며 스플라이서를 피해다니고,
넵튠의 은혜로 가서 아틀라스의 가족을 만나려 한다.
#2
리틀 시스터는 아담을 채취하고 빅 대디는 리틀 시스터를 지킨다는 것을 아틀라스를 통해 알게 된다.
넵튠의 은혜로 가는 도중 앤드류 라이언에게 발각되어 갇히고 타국 정보기관에서 보낸 첩자로 의심받는다.
아틀라스에 의해 구출되고 의료 시설 방향으로 도망.
의료 시설에 있는 비상 통로를 통해 넵튠의 은혜로 가려 하지만 비상 통로를 사용하려면 스타인먼이 가진 열쇠가 필요.
스타인먼을 찾아 열쇠를 얻으려 한다.
#3
화염 공격 플라스미드를 발견, 화염 공격이 가능해진다.
샷건을 얻어 무기가 렌치, 권총, 기관총, 샷건으로 늘어났다.
수종 박사와 테넨바움이 일지를 통해 새로이 등장. 수종 박사가 연구하던 염력 플라스미드로 염력 사용이 가능해진다.
스타인먼과 조우했지만 도망가는바람에 다시 추적하고 있다.
#4
수술실에서 비밀 통로를 여는 스타인먼과 전투. 정의의 렌치로 응징을 가하고 열쇠를 얻는다.
비밀 통로로 가던 도중 빅 대디를 잃은 리틀 시스터를 만나는데 테넨바움 역시 만나게 된다.
아틀라스는 생존을 위해 리틀 시스터에게서 아담을 빼앗으라고 하지만 테넨바움은 동정심에 호소. 결국 플레이어는 자비를 베푼다.
이후 이동 중 또 다른 빅 대디와 리틀 시스터를 만나지만 빅 대디를 처음으로 처치하고 리틀 시스터는 역시 구원한다.
아틀라스를 만나기 위해 잠수정을 타고 넵튠항으로 향한다.
#5
넵튠의 은혜라는 항구에 도착. 폰테인 수산의 숨겨진 잠수함에서 아틀라스와 그의 가족을 만나기로 약속한다.
플레이어를 리틀 시스터로 인식하도록 만들어 빅 대디에게 호위를 받는 플라스미드를 얻는다.
폰테인 수산에 도착했지만 피치 윌킨스란 녀석이 문을 열어주지 않고 연구용 카메라를 가져오면 문을 열어주겠다고 한다.
